gözleg

Fosforilasiýa, H2A gistonynyň hromatin bilen birleşmegini öňe sürmek bilen Arabidopsisde esasy ösüş sazlaýjy DELLA-ny işjeňleşdirýär.

DELLA beloklary konserwasiýa ussadydyrösüşi sazlaýjyiçerki we daşky gurşaw meselelerine jogap hökmünde ösümlikleriň ösüşine gözegçilik etmekde esasy rol oýnaýar. DELLA transkripsiýa düzgünleşdiriji hökmünde çykyş edýär we GRAS domeni arkaly transkripsiýa faktorlaryny (TF) we H2A gistonyny baglanyşdyrmak arkaly mahabatlandyryjylara işe alynýar. Soňky gözlegler, DELLA durnuklylygynyň iki mehanizmiň üsti bilen terjime edilendigini görkezdi: fitohormon gibberelliniň çalt zaýalanmagyna sebäp bolýan polýubikuitasiýa we toplanmagyny ýokarlandyrmak üçin kiçijik ubiquitine meňzeş üýtgeýjileriň (SUMO) birleşmegi. Mundan başga-da, DELLA işjeňligi iki dürli glikozilasiýa bilen dinamiki tertipleşdirilýär: DELLA-TF täsiri O-fukosilasiýa bilen güýçlendirilýär, ýöne O bilen baglanyşykly N-asetilglukosamin (O-GlcNAc) üýtgemegi bilen saklanýar. Şeýle-de bolsa, DELLA fosforilýasiýanyň roly düşnüksiz bolup galýar, sebäbi öňki barlaglar fosforilasiýanyň DELLA zaýalanmagyny öňe sürýändigini ýa-da peseldýändigini görkezýänlerden başlap, fosforilýasiýanyň durnuklylygyna täsir etmeýändigini görkezýänlerden başlap, gapma-garşy netijeleri görkezýär. Bu ýerde, REPRESSOR-da fosforilýasiýa saýtlaryny kesgitleýärisga1-3(RGA, AtDELLA) köpçülikleýin spektrometriýa derňewi arkaly Arabidopsis talianadan arassalanyp, PolyS we PolyS / T sebitlerinde iki RGA peptidiniň fosforilýasiýasynyň H2A baglanyşygyny we RGA işjeňligini ýokarlandyrýandygyny görkezýär. Maksatly höweslendirijiler bilen RGA birleşmesi. Fosforilýasiýa RGA-TF täsirine ýa-da RGA durnuklylygyna täsir etmeýär. Biziň gözlegimiz, fosforilasiýanyň DELLA işjeňligini döredýän molekulýar mehanizmini açýar.
DELLA funksiýasyny kadalaşdyrmakda fosforilasiýanyň roluny düşündirmek üçin DELLA fosforilýasiýa ýerlerini wivo görnüşinde kesgitlemek we ösümliklerde funksional derňew geçirmek möhümdir. MS / MS derňewi bilen ösümlik ekstraktlaryny ýakyn arassalamak bilen, RGA-da birnäçe fosfositi kesgitledik. GA ýetmezçiligi şertlerinde RHA fosforilýasiýa ýokarlanýar, ýöne fosforilýasiýa onuň durnuklylygyna täsir etmeýär. Möhüm zat, bilelikde IP we ChIP-qPCR gözlegleri, RGA-nyň PolyS / T sebitindäki fosforilýasiýanyň H2A bilen täsirini we maksatly höweslendirijiler bilen birleşmegini ösdürýändigini, fosforilýasiýanyň RGA işine itergi berýän mehanizmini açýandygyny görkezdi.
RGA, LHR1 subdomeniniň TF bilen täsiri arkaly hromatini nyşana almak üçin işe alynýar we soňra PolyS / T sebiti we PFYRE subdomain arkaly H2A bilen baglanyşýar we RGA-ny durnuklaşdyrmak üçin H2A-RGA-TF toplumyny emele getirýär. DELLA domeni bilen GRAS domeniniň arasyndaky PolyS / T sebitindäki Pep 2-iň fosforilýasiýasy, näbelli kinase tarapyndan RGA-H2A baglanyşygyny güýçlendirýär. Rgam2A mutant belogy RGA fosforilýasiýasyny ýatyrýar we H2A baglanyşygyna päsgel bermek üçin başga bir belok görnüşini kabul edýär. Bu wagtlaýyn TF-rgam2A täsirleriniň durnuksyzlaşmagyna we rgam2A-nyň maksatly hromatinden bölünmegine getirýär. Bu suratda diňe RGA-töwellaçylykly transkripsiýa repressiýasy görkezilýär. HGAA-RGA-TF toplumynyň maksatly gen transkripsiýasyny öňe sürjekdigi we rgam2A-nyň deposforilýasiýasy transkripsiýanyň azalmagyndan başga, RGA-töwekgelçilikli transkripsiýa işjeňleşdirilmegi üçin şuňa meňzeş nagyş beýan edilip bilner. Surat Huang we başg.
Quhli mukdar maglumatlary Excel-iň kömegi bilen statistik taýdan derňeldi we Talyplaryň synagyndan peýdalanyp düýpli tapawutlar kesgitlenildi. Mysal ölçegini deslapky kesgitlemek üçin hiç bir statistik usul ulanylmady. Derňewden hiç hili maglumat aýrylmady; tejribe tötänleýin bolmady; gözlegçiler synag wagtynda maglumatlaryň paýlanmagyna we netijelere baha berilmegine göz ýummadylar. Nusga ölçegi şekil rowaýatynda we çeşme maglumat faýlynda görkezilýär.
Okuw dizaýny barada has giňişleýin maglumat üçin bu makala bilen baglanyşykly Tebigy Portfolio Hasabatynyň Abstraktyna serediň.
Köpçülik spektrometri proteomika maglumatlary, PXD046004 maglumat bazasy kesgitleýji bilen PRIDE66 hyzmatdaş ammary arkaly ProteomeXchange konsorsiumyna goşant goşdy. Bu gözlegiň dowamynda alnan beýleki maglumatlaryň hemmesi Goşmaça maglumatlar, goşmaça maglumatlar faýllary we çig maglumatlar faýllarynda görkezilýär. Bu makala üçin çeşme maglumatlary berilýär.

 

Iş wagty: Noýabr-08-2024